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手机短信拦截对方是否会知道，取决于使用的拦截方式和设置。
1、如果仅仅是设置了拦截所有陌生短信，那么对方收到的是发送成功的提示，实际上短信内容不会被成功接收，对方不会知道短信被拦截。
2、如果使用的是一些特殊的拦截工具或软件，可能会有提示短信被拦截的提示信息，此时对方可能会知道短信被拦截，如果手机开启了短信报告功能，对方可能会收到短信报告通知短信已被拦截，如果运营商提供了短信拦截服务，对方也可能会知道短信被拦截，建议在设置拦截时，根据自己的需求和隐私考虑选择合适的拦截方式。
如果想避免让对方知道短信被拦截，可以选择只设置拦截陌生短信的方式，但需要注意的是，即使对方不知道短信被拦截，长时间不回复或频繁拦截可能会让对方产生疑虑并主动联系确认情况。